2018年5月28日，菲律賓馬尼拉市發生的一場大火差點讓菲律賓國家檔案館毀于一旦。此次大火的起火點在距菲律賓國家檔案館兩棟建筑樓的土地管理局，經過消防員的奮力撲救，大火燃燒12小時后，在蔓延到菲律賓國家檔案館所在的范倫那大廈3層之前被撲滅。
火災發生時，菲律賓國家檔案館的工作人員第一時間將館內的珍貴歷史檔案搶救出來，菲律賓國家歷史委員會派出貨車幫助運輸檔案。經由消防員、檔案人員和社會各方的共同努力，菲律賓國家檔案館所藏的美國殖民時期以及西班牙殖民時期的珍貴歷史檔案被安全轉移。不過一些館藏行政檔案在滅火過程中被水浸濕，目前菲律賓國家檔案館的檔案修復人員正在搶救這些檔案。
菲律賓國家檔案館成立于2007年，是菲律賓國家文化藝術委員會的附屬機構，目前，在全國約有150名員工，年預算約為1.6億美元。
菲律賓國家檔案館保存的出生和死亡檔案、城鎮規劃檔案以及稅收記錄為人們了解和研究16世紀第一次全球化的歷史以及西班牙殖民時期菲律賓人民的生活狀況提供了珍貴的資料。鑒于這些檔案的重大歷史價值，菲律賓國家檔案館將這些珍貴歷史檔案進行了數字備份、制作了縮微膠卷，并將其異地保存。
火災的發生，引起了菲律賓民眾對國家檔案館的關注，菲律賓國家檔案館將通過定期舉辦展覽、加強宣傳教育、提供在線利用服務等方式加深人們對檔案館的了解。
