1月24日，福建省啟動重大突發公共衛生事件一級響應。1月26日，福建省檔案局發布《關于做好新型冠狀病毒感染肺炎疫情防控工作的通知》（以下簡稱《通知》）。為進一步做好新型冠狀病毒感染肺炎疫情防控工作，福建省檔案館黨組高度重視，第一時間成立應對新型冠狀病毒感染肺炎疫情工作領導小組，按照福建省“兩辦”印發《福建省應對新型冠狀病毒感染肺炎疫情工作領導小組工作方案》和省檔案局《通知》要求，分別于1月28日、2月3日制定并完善形成福建省檔案館《關于新型冠狀病毒感染肺炎疫情的防控方案（一）（二）》，采取多項防控措施，切實承擔起館內疫情防控主體責任。
一是優化組織領導機構。補充完善應對新型冠狀病毒感染肺炎疫情工作領導小組，在由主要領導任組長，副館長和二級巡視員任副組長，各處室負責人和一級巡視員任成員的基礎上，各處室（含海峽人才市場、物業、食堂、有關公司等）選派一名同志任安全員，負責各處室防控工作的聯絡和具體落實。
二是加大監測排查力度。對全體同志及其家屬健康狀況進行摸底排查，并實行每日疫情防控報告制度，做好人員健康登記，由各處室安全員每日向領導小組報告。要求到崗干部職工和來館辦事人員自覺接受體溫檢測，必須佩戴口罩，有特殊情況及時報告和就醫，杜絕疫情輸入。
三是加強館區衛生管理。細化館內外環境衛生整治和消毒防疫措施，每日對查檔大廳、展廳、食堂、衛生間、樓梯等人群聚集重點區域進行消毒；每2小時電梯消毒一次；辦公場所每日通風3次；設置廢棄口罩專用垃圾桶，統一消毒處理。
四是自覺個人衛生防護。要求所有工作人員（含干部職工、檔案利用者和中國海峽人才市場、物業、數字化公司、食堂人員以及其他外包服務人員等）入館前，必須進行體溫檢測。強調乘坐公共交通工具、多人辦公、接待外來人員、參加會議、傳遞文件時，落實佩戴口罩、勤洗手等防控措施。按要求填報《工作人員健康信息報告單》，對隱報個人健康信息的將嚴肅追究相關責任。
五是嚴格食堂安全管理。每天對食堂人員進行晨檢，按規定管好廚余垃圾，保持良好衛生環境。開放小餐廳和包廂供干部職工使用，安排分段就餐，提出避免扎堆就餐、面對面就餐、就餐說話等要求。
六是強化外來人員管控。疫情防控期間，外包公司人員上班時間不早于2月9日24時。在網站、微信公眾號和館大門等處發布閉館公告，并公布網絡查檔和電話查檔方式。確因工作需要來訪或開展必要工作的，必須檢測體溫、登記身份信息，并佩戴口罩。
七是從嚴控制用車管理。嚴格公務車輛報批手續，派車盡量避開出現疫情區域，并做好公務車輛清潔消毒工作。定制公交實行車長制，指定車長和副車長，負責督促干部職工上車時檢測體溫和佩戴口罩。
八是快速果斷處置疫情。工作人員及其家屬一旦出現癥狀或疑似病例，第一時間報告館防控辦，積極配合醫療機構做好當事人及其密切接觸者隔離觀察治療工作，防止疫情擴散。
九是注重宣傳教育引導。利用微信、網站、宣傳欄、電子顯示屏等，開展新型冠狀病毒感染肺炎防控知識宣傳，及時掌握干部職工思想動態，有針對性做好思想引導工作，引導其不信謠、不造謠、不傳謠，增強打贏疫情防控阻擊戰的信心決心。
十是確保工作安全有序。2月3日恢復工作后，積極開展網上查檔、電話查檔等服務，保障公眾需求。分類對干部職工（含公司員工）返崗時間進行安排，根據實際情況采取網上辦公的方式開展工作。
十一是做好老干關懷幫扶。要求機關黨委（人事處）引導老干部加強自身和家人防護，準確了解掌握老干部情況，及時做好登記（包括日期、姓名、性別、年齡、活動區域、體溫等信息），并向館防控辦報告，全力保障老干部身體健康。
